Territoire
La zone Etchemin | Lévis-Est est un territoire de 1 581 km², composé de treize sous-bassins versants, eux-mêmes constitués de plusieurs affluents, s’écoulent vers le fleuve St-Laurent.
Sur 1 581 km², vivent plus de 49 000 habitants, répartis dans 26 municipalités ainsi que la ville de Lévis. Environ 30 % de ce territoire est occupé par des terres agricoles, plus de 35 000ha de terres cultivées et 780 000 unités animales. Sur l’ensemble du bassin versant de la rivière Etchemin, on peut compter environ 131 industries, en agroalimentaire, en métallurgie, en plastique, en produit du bois… Malgré tout 70 % du territoire est occupé par des forêts.
Toutes ces activités ont un impact plus ou moins important sur la qualité de l’eau.
Secteur Etchemin
D’une superficie de 1466 km², le secteur Etchemin concerne essentiellement le bassin versant de la rivière Etchemin. Son territoire recoupe celui de quatre municipalités régionales de comtés, 25 municipalités, dont la Ville de Lévis.

Basse Etchemin
Superficie : 209,4 km²
Municipalités touchées : Sainte-Claire, Saint-Henri, Saint-Anselme
Rivière d’importance : Etchemin

Pénin
Superficie : 25,9 km²
Municipalités touchées : Sainte-Jean-Chrysostome
Rivière d’importance : Pénin

Le Bras
Superficie : 227,3 km²
Municipalités touchées : Sainte-Isidore, Scott, Saint-Hénédine
Rivière d’importance : Le Bras, ruisseau Fourchette, Décharge de la Grande-ligne

Abénaquis
Superficie : 191,9 km²
Municipalités touchées : Sainte-Nérée, Armagh, Saint-Damien-de-Buckland
Rivière d’importance : Abénaquis

Centre Etchemin
Superficie : 108,1 km²
Municipalités touchées : Sainte-Malachie
Rivière d’importance : Etchemin, ruisseau Hémisson

Monts de Frampton
Superficie : 152,3 km²
Municipalités touchées : Frampton
Rivière d’importance : Desbarats

Aux fleurs eau chaude
Superficie : 224,6 km²
Municipalités touchées : Buckland, Saint-Léon-de-Standon
Rivière d’importance : Etchemin, Eau chaude, aux fleurs

Haute Etchemin
Superficie : 326,5 km²
Municipalités touchées : Lac-Etchemin,Saint-Luc-de-Bellechasse, Sainte-Sabine
Rivière d’importance : Etchemin
Secteur Lévis-Est
Le secteur Lévis-Est représente un ajout de 115 km2 au bassin versant principal de la rivière Etchemin, ajout réalisé en 2010 et qui vient augmenter la zone d’intervention du CBE.

À la Scie
Superficie : 40,1 km²
Municipalités touchées : Ville de Lévis
Rivière d’importance : Rivière à la Scie

Des Couture (Sous bassin de à la Scie)
Superficie : 35,7 km²
Municipalités touchées : Ville de Lévis
Rivière d’importance : Rivière des Couture

Lallemand
Superficie : 5,1 km²
Municipalités touchées : Ville de Lévis
Rivière d’importance : Ruisseau Lallemand

Rouge
Superficie : 7,3 km²
Municipalités touchées : Ville de Lévis
Rivière d’importance : Ruisseau rouge

Ville-Guay
Superficie : 0,85 km²
Municipalités touchées : Ville de Lévis
Rivière d’importance : Ruisseau Ville-Guay

Pointe-de-Lévis
Superficie : 0,85 km²
Municipalités touchées : Ville de Lévis
Rivière d’importance : Cours d’eau de la ferme Chapais